Janus Lee spielt in der fiktiven Landmark City und ist der Leiter von Lee Industries, der einen Fernsehwettbewerb veranstaltet, um eine Gruppe talentierter Teenager zu rekrutieren. Die Gewinner des Wettbewerbs, Axel, King, Lioness, Hawk und Shark, erhalten Prototypen von Waffen, Gadgets und Fahrzeugen und kämpfen gemeinsam gegen den kriminellen Mastermind Alexander Paine, der auch für den Tod von Axels Vater verantwortlich ist, sowie seine Schergen Spydah und Fleisch. Am Ende der ersten Staffel schaffen sie es, ihn und seine Bande zu besiegen.
Es zeigt sich jedoch, dass Lees wahrer Zweck darin bestand, die DNA der Teenager zu verwenden, um Klone zu erzeugen, die mit tierischen Genen betrieben werden. In der zweiten Staffel müssen sich die Alpha Teens erneut zusammenschließen, um Lee und seine Armee von Mutanten aufzuhalten.