Zehn Jahre nach dem Ende des Krieges gegen Dr. Hell und seine mechanischen Bestien lebt die Welt dank der Entwicklung von photonischer Energie für friedliche Zwecke in einer Ära des Friedens. Der Pilot von Mazinger Z, Koji Kabuto, ist nach seinem Vater und Großvater ein angesehener Wissenschaftler geworden, während Sayaka Yumi jetzt der Direktor des Photonenforschungsinstituts ist, nachdem ihr Vater, Dr. Yumi, der japanische Premierminister wurde. Tetsuya Tsurugi, die Pilotin von Great Mazinger, ist immer noch im Militär und mit Jun Hono verheiratet, der ihr erstes Kind erwartet. Kojis jüngerer Bruder Shiro ist ebenfalls Militär-Mecha-Pilot.
Beim Bau des neuen Institutsgebäudes finden sie einen riesigen Roboter unter dem Berg. Fuji, den sie Infinity codenamen. Als Koji nachforscht, taucht ein Mädchen von innen auf. Lisa ist die Hauptsteuereinheit des Roboters, eine 91% organische KI mit Gefühlen. Kurz zuvor attackierte der mutmaßliche Tote Dr. Hell das Institut mit neuen Mechanical Beasts sowie seinen Handlangern Baron Ashura und Count Brocken und stahl die Unendlichkeit mit einem erbeuteten Tetsuya und Great Mazinger als improvisierten Aktivierungsschlüssel, da er dies nicht konnte Lisa holen. Lisa enthüllt, dass die Endkraft der Unendlichkeit die Goragora ist, die Fähigkeit, ihr Universum mit einem anderen auszutauschen, indem sie eine erzwungene Quantenüberlappung verursacht. Dr. Hell plant, es zu benutzen, da er glaubt, dass diese Welt es nicht wert ist zu existieren.
Dr. Nossori und Dr. Sewashi bauen einen neuen Mazinger Z mit einem riesigen photonischen 3D-Energiedrucker. Koji und Lisa im neuen Mazinger Z infiltrieren das eingedrungene Photoneninstitut und bekämpfen die mechanischen Bestien im Inneren. Nach dem Sieg über Baron Ashura und Graf Brocken tritt Mazinger Z gegen Dr. Hells Roboter an, ist jedoch schwer beschädigt. Shiro rettet Great Mazinger und sie stoppen den Goragon Countdown, aber Dr. Hell hat eine Sicherungskopie von Great Mazingers Aktivierungscode auf seinem Bardos-Zepter und übernimmt die Kontrolle über Infinity, wodurch Goragon aktiviert wird.
In der angrenzenden Dimension sieht Koji ein alternatives Universum, in dem Lisa seine und Sayakas Tochter ist. Lisa benutzt sich als Schlüssel, um Mazinger eine Kraft zu verleihen, die der von Infinity entspricht, indem sie photonische Energie in Materie umwandelt. Jeder auf dem Planeten gibt Mazinger Z seine photonische Energie und Koji schlägt Infinity mit Dr. Hell auf den Planeten, wo er explodiert. Lisa verschwindet und versichert Koji, dass sie sich wieder sehen werden. In der Zwischenzeit bringt Jun sie und Tetsuya zur Welt.
Danach heiraten Koji und Sayaka und sie werden gesehen, wie sie mit einem Kind Lisa gehen.
https://en.wikipedia.org/wiki/Mazinger_Z:_Infinity