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Die Serie folgt Makoto, Adi und Chloe, drei Teenagern, die von Hydra erzogen wurden, um zu glauben, dass sie zu Superhelden ausgebildet werden und dass die Avengers Bösewichte sind. Die drei wurden von Hydra genetisch verändert, was dazu führte, dass jeder einzigartige übermenschliche Fähigkeiten erlangte. Als Adi und Chloe zum ersten Mal auf eine Mission geschickt werden, erkennen sie Hydras böse Absichten und beschließen, die Organisation zu verlassen und Makoto dazu zu bringen, sich ihrem Fluchtversuch anzuschließen. Makoto wird der einzige, der entkommt, und er geht zu Tony Stark, um Hilfe zu suchen, um Adi und Chloe zu retten. Tony bringt die anderen Avengers mit, und mit Makotos Hilfe gelingt es ihnen, Hydra zu besiegen und Adi und Chloe zu befreien. Die Avengers erkennen das Potenzial, das sie haben, und beschließen, die drei aufzunehmen und sie zu Superhelden auszubilden, und nennen das Team die "Future Avengers". Während sie die neuen Rekruten ausbilden, versuchen die Avengers auch, mehr über das „Emerald Rain Project“ zu erfahren, ein gefährliches Schema, das von Hydra und den Masters of Evil orchestriert wird, und welche Verbindung es zu Makoto hat. Die Sache wird noch komplizierter, als Bruno, ein weiterer gentechnisch veränderter Teenager und auch Makotos ehemaliger Trainingspartner, dazu manipuliert wird, sich den Reihen der Masters of Evil anzuschließen.

https://en.wikipedia.org/wiki/Marvel_Future_Avengers