Sakuta Azusagawa ist ein Oberschüler und an seiner Schule ein Außenseiter, seit er für die Einweisung dreier Mitschüler ins Krankenhaus verantwortlich gemacht wird. Sein Leben ändert sich, als er die jugendliche Schauspielerin Mai Sakurajima in einem Hasenkostüm durch die Bibliothek umherwandern sieht und niemand sie wahrzunehmen scheint. Mai ist fasziniert, dass Sakuta der Einzige ist, der ihre Präsenz wahrnehmen kann. Sakuta nennt dieses Phänomen „Pubertäts-Syndrom“ und beschließt dieses Mysterium aufklären zu wollen. Dabei versucht er eine Beziehung zu Mai aufzubauen und trifft dabei auf weitere Mädchen, die an dem Syndrom leiden.