Die Serie handelt von Stefan Vollmer, einem Lehrer für Deutsch, Naturwissenschaften und Sport. Nach zehn Jahren Abwesenheit kehrt er wieder in den Schuldienst zurück. Schon bald entpuppt sich sein neuer Arbeitsplatz, die Gesamtschule Georg Schwerthoff, als Problemzone. In den Fluren herrscht Anomie und Stefan Vollmer wird bald als Experte für den G-Kurs abgestellt, bei dem es sich um die chaotischste Klasse der ganzen Schule handelt. Mit alternativen, unkonventionellen Methoden und einer anderen Umgangsweise bringt er jedoch schon bald die Schüler hinter sich und schafft es, nach und nach deren Einstellung gegenüber der Schule zu verändern.
Als mit Beginn der zweiten Staffel die Lehrerin Karin Noske an die Schule kommt, bahnt sich langsam eine Romanze zwischen ihr und Vollmer an. Am Ende der Staffel will sie mit ihrem Lebensgefährten nach Boston in die USA ziehen, entscheidet sich aber im letzten Moment doch dafür, in Deutschland zu bleiben. Das bekommt jedoch Stefan Vollmer nicht mit, der – ebenfalls im letzten Moment – auch ein Ticket für das Flugzeug kauft, um ihr seine Liebe zu gestehen. In dieser Staffel erfährt Vollmer außerdem, dass er einen unehelichen schwulen Sohn hat.
Zu Beginn der dritten Staffel brennt die benachbarte Hauptschule ab, so dass die Schüler dieser Schule nun auch auf der Gesamtschule unterrichtet werden. Die Romanze zwischen Stefan Vollmer und Karin Noske erfährt ein kontinuierliches Auf und Ab, bis sie sich am Ende küssen und zusammenkommen. In der vierten Staffel setzt sich das Auf und Ab fort.
Außerdem erfährt man im Laufe der vierten Staffel, dass Direktor Günther Rose eine Tochter hat, zu der er viele Jahre wegen seines Alkoholproblems keinen Kontakt hatte. Des Weiteren endet für Vollmers G-Kurs die Schulzeit mit ihrem erfolgreichen Abschluss und nach den Sommerferien beginnt ein neues Schuljahr mit einer neuen Klasse, dem Oberstufenkurs.
Karin Noske nimmt eine Rektorenstelle in Lemgo an und tritt diese zu Beginn der fünften Staffel an. Sie ist schwanger, weiß jedoch nicht, ob von Vollmer oder ihrem besten Freund Michael, da sie während der Beziehung mit Michael einmal Geschlechtsverkehr mit Vollmer hatte. Sie kommt wieder mit Vollmer zusammen und kehrt zurück an die Schule nach Köln, wo ihre Mutter inzwischen eine Beziehung mit Rose begonnen hat. Die fünfte Staffel endet mit der Geburt des Babys in der Schule und den beiden Vätern, die die Nabelschnur durchschneiden sollen.
Zu Beginn der sechsten Staffel klärt sich die Vaterschaft, Vater ist Michael. Patrick Petzold (Eugen Bauder) kommt als neuer Kollege an die Georg-Schwerthoff-Gesamtschule. Er ist von Karin angetan, kann seine Gefühle ihr gegenüber aufgrund der Beziehung mit Stefan aber nicht zeigen. Zwischenzeitlich bestätigt er eine Vermutung Noskes, homosexuell zu sein. Stefan durchschaut ihn und verlangt, dass er es Karin selbst beichtet. Letztlich kann er ihr seine Heterosexualität erst durch einen Kuss beweisen. Zu Ende der Staffel wollen Stefan und Karin heiraten. Es kommt jedoch zu einem Gasleck im Hochzeitszelt, das zu einer Explosion führt. Cliffhängenderweise wird offen gelassen, ob alle dieses Unglück überlebt haben.
Am Anfang der siebten Staffel stellt sich heraus, dass Karin sich durch die Explosion an die letzten drei Jahre nicht mehr erinnern kann. Stefans Versuche, ihre Erinnerung durch den Besuch prägnanter Orte wiederzubeleben, scheitern. Erst auf dem Abschlussball des Abiturjahrgangs kann Karin sich wieder erinnern, als ihr bewusst wird, dass sie Tango kann und Stefan liebt. Im weiteren Verlauf der Staffel versöhnt sich Stefan mit seiner Mutter, nachdem ihm bewusst wird, dass er sie nach dem Tod seines Vaters, zu dem er eine sehr enge Bindung hatte, ungerechterweise weggestoßen hat. Bei einem Schulexperiment, bei dem die Blutgruppen von Michael und Frida bestimmt werden, kommt heraus, dass Michael nicht der Vater von Frida sein kann. Ein weiterer Test bestätigt dann, dass Stefan der Vater ist. Ebenfalls stellt sich heraus, dass Karin an einer unheilbaren Form von Schilddrüsenkrebs leidet. Am Ende der siebten Staffel stirbt Karin schließlich daran. Ein Zeitsprung erfolgt, fünf Jahre später. Jonas, Stefans Sohn, ist mittlerweile Lehrer geworden und wohnt zusammen mit Stefan und Frida in dem Haus. Stefan findet durch Zufall einen USB-Stick mit einer Nachricht von Karin, wo sie sich bei ihm für alles bedankt.
Staffel 8 beginnt 5 Jahre nach dem Tod von Karin Vollmer in Staffel 7: Frida, die Tochter von Stefan Vollmer und Karin, ist inzwischen sechs Jahre alt und wird in die Grundschule eingeschult. Stefan lernt in der ersten Folge eine junge Frau namens Sara kennen, mit der er einen One Night Stand eingeht. Später erfährt Vollmer, dass Sara ein ähnliches Schicksal teilt wie er. Am Ende der dritten Folge zieht Stefans Sohn Jonas Burmeister aus dem Hause Vollmer aus und verlässt vorerst die Serie. Wie üblich, kümmert sich Stefan um die Notlagen seiner Schüler, unter anderem bei Themen wie Umweltschutz, vorgetäuschter Taubheit, Ausgrenzung und noch einige mehr. Doch auch Stefan wird immer noch von der Trauer um seine geliebte Karin verfolgt, lässt sich äußerlich jedoch nie wirklich etwas anmerken. Die Trauer bleibt auch weiterhin im Verlauf der Serie bestehen. Barbara und Karl haben inzwischen einen Sohn Namens Luke und gegen Ende der Staffel wird Barbara mit einem Mädchen schwanger. Nachdem aus Stefan und Sara nichts geworden ist, geht er eine kleine On-Off-Beziehung mit Fridas Klassenlehrerin Rebecca ein, doch die Trauer um Karin macht ihm eine neue Beziehung noch nicht möglich. In der letzten Folge kommt es zum emotionalen Höhepunkt der Staffel: Stefan wird unter einer Fliegerbombe aus dem Zweiten Weltkrieg eingeklemmt. Sara kommt hinzu und versucht, die Bombe zu entschärfen – was dann auch gelingt. Die Staffel endet damit, dass Stefan Frida liebevoll umarmt und seinen traurigen Gefühlen nachgibt und anfängt zu weinen.