Der Film spielt ca. 6000 Jahre vor der Serie, zur Zeit des großen Krieges, in dem ganze Sterne zerstört wurden. Um nicht unterzugehen, unterwarf sich die komplette Menschheit Riku. Während einer Expedition finden sie Shuvi, eine weibliche Maschine. Riku beschließt, ihr beizubringen was ein richtiges menschliches Herz ist und wie es funktioniert.